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Stephan Lorenzen

Angestellt, Wissenschaftlicher Mitarbeiter, Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin
Hamburg, Deutschland

Fähigkeiten und Kenntnisse

Next Generation Sequencing
Bioinformatik
Genexpression
Transcriptomics
RNA-seq
Programmierung

Werdegang

Berufserfahrung von Stephan Lorenzen

  • Bis heute 11 Jahre und 5 Monate, seit Jan. 2014

    Wissenschaftlicher Mitarbeiter

    Bernhard-Nocht-Institut für Tropenmedizin

    Bioinformatische Auswertung von NGS-Experimenten, Charakterisierung von Sequenzvarianten, Assemblierung neuartiger Viren aus Feldisolaten, RNA-Seq unterschiedlicher Spezies, Assemblierung von Multigenfamilien, Sequenzierung und Annotation

  • 1 Jahr und 6 Monate, Juli 2012 - Dez. 2013

    Wissenschaftlicher Mitarbeiter

    Universitätsmedizin Göttingen

    Genetische Analyse von Rektalkarzinomen mittels NGS und Microarrays, Analyse von Sequenzvarianten als Risikofaktoren für Karzinogenese, Statistische Programmierung, Ereigniszeitanalysen und statistische Beratung für klinische Arbeitsgruppen

  • 2 Jahre und 6 Monate, Jan. 2010 - Juni 2012

    Wissenschaftlicher Mitarbeiter

    Charité - Universitätsmedizin Berlin / Friedrich-Schiller-Universität Jena

    Metaanalyse von Genregulation aus Microarray- und NGS-Daten, Kreuzkorelation von Genexpression zwischen verscheidenen Datensätzen, Systembiologie genregulatorischer Netzwerke, Sequenzuntersuchung von Transkriptionsfaktorbindestellen. 2011 Umzug der Arbeitsgruppe an die Universitätsklinik Jena

  • 1 Jahr, Jan. 2009 - Dez. 2009

    Postdoktorand

    Charité - Universitätsmedizin Berlin

    Auffinden zirkadianer Muster in Genexpressionsdaten, Regulatorische Netzwerke zirkadianer Rhythmen, Mathematische Modellierung von Leberregeneration und Zellzyklus, Statistische Analyse von Promotoren und Transkriptionsfaktorbindestellen, Statistische Auswertung von Zeitreihendaten

  • 2 Jahre, Feb. 2007 - Jan. 2009

    Stipendiat

    Freie Universität Berlin

    Molekulardynamische Simulation von Proteininteraktionen, Packungsanalysen und Strukturvorhersagen von Transmembrandomänen, Helix-Helix Interaktionen in verschiedenen Klassen von Proteinen, Chemical Force Fields

  • 1 Jahr und 3 Monate, Nov. 2005 - Jan. 2007

    Postdoctoral Fellow

    University of Kansas

    Strukturvorhersage von Proteinkomplexen, Monte Carlo Algorithmen zum Protein-protein docking, Strukturverfeinerung und Seitenkettenoptimierung von Proteinkomplexen, Clusterverfahren zur Validierung von Docking-decoys

Ausbildung von Stephan Lorenzen

  • 4 Jahre und 2 Monate, Okt. 2001 - Nov. 2005

    Theoretische Biologie

    Charité

    Struktur- und Bindungsvorhersagen aus Proteinsequenzen; Proteinstrukturen

  • 5 Jahre, Okt. 1996 - Sep. 2001

    Biochemie

    Freie Universität Berlin

    Aufreinigung des peroxisomalen Dockingkomplexes; Proteinimport in S. cerevisiae; Proteininteraktionen

Sprachen

  • Deutsch

    Muttersprache

  • Englisch

    Fließend

  • Vietnamesisch

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