Arbeiten an der Charité

Im Rahmen des vom Bundesministerium für Bildung und Forschung geförderten Projekts xG-RIC ("Next Generation Communication Networks Research and Innovation Cluster") arbeiten wir gemeinsam mit dem Fraunhofer Heinrich-Hertz-Institut (HHI) an der Entwicklung innovativer 6G-Anwendungen für den medizinischen Bereich. Ein zentrales Forschungsziel ist die Entwicklung von dynamischen Digitalen Zwillingen für komplexe klinische Szenarien – etwa beim Schock, akuten Lungenversagen (ARDS) oder Post-Intensive-Care-Syndrom (PICS). Diese Digitalen Zwillinge sollen interoperable Echtzeitdaten und KI-gestützte Analytik nutzen, um physiologische und pathologische Zustände präzise zu modellieren, zu simulieren und zukünftige Entwicklungen vorherzusagen. Weiteres Forschungsziel ist die Integration kabel-loser IoT-Systeme mit gegenwärtigen Monitoringsystemen auf der Intensivstation, um die mit konventioneller Überwachung einhergehenden Einschränkungen der Immobilität zu reduzieren, zirkadiane Störungen zu behandeln und hämodynamische Risiken präziser zu erfassen. Schließlich soll eine mobile, datengestützte Nachsorge nach intensivstationärer Therapie weiterentwickelt werden, um frühzeitig postintensivmedizinische Genesungsstörungen zu erkennen und zu behandeln. Mit diesen drei Forschungszielen können klinische Prozesse und Behandlungsstrategien datenbasiert verbessert werden. Die technologischen Grundlagen – ultraniedrige Latenz, hohe Konnektivität und verteilte Intelligenz – werden im Projekt xG-RIC exploriert und deren Nutzung in der Medizin in Form oben genannter Anwendungsfälle erforscht.

Die Stelle im Überblick

• Mitarbeit an der Entwicklung, Integration und Analyse von bioinformatischen ML und KI-basierten Modellen im Rahmen des Projekts xG-RIC
• Konzeption, Aufbau und Pflege von Datenpipelines zur Verarbeitung und Analyse klinischer Echtzeit- und Sensordaten
• Entwicklung von Methoden zur Kopplung biomedizinischer Datenströme mit digitalen Zwillingen (z. B. Vitalparameter, Bildgebung, Labordaten)
• Mitarbeit an der Erstellung von Simulationsumgebungen zur Abbildung von Patientenzuständen und Krankenhausprozessen
• Unterstützung bei der Implementierung verteilter KI-Modelle (Edge-/Cloud-Computing) in Kooperation mit Informatik- und Ingenieurteams
• Datenintegration von IoT und Monitoring Systemen auf Intensivstationen
• Unterstützung bei der Entwicklung einer mobilen, datengestützten Nachsorge nach intensivstationärer Therapie
• Sicherstellung von Datenqualität, Reproduzierbarkeit und FAIR-konformer Dokumentation
  Mitwirkung bei wissenschaftlichen Publikationen und Präsentationen

Danach suchen wir

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Bachelor oder Diplom) in Bioinformatik, Informatik mit Schwerpunkt Bioinformatik, Biomathematik, Computational Biology oder vergleichbar - Masterabschluss muss bei Vertragsunterzeichnung vorliegen
• Erfahrung mit international anerkannten semantischen und syntaktischen Standards im Gesundheitswesen (z. B. HL7 FHIR, LOINC, SNOMED CT, ICD, OMOP) sowie Verständnis für deren Anwendung in interoperablen Systemarchitekturen.
• Erfahrung in der Integration von Daten- und Service-Ökosystemen für Digital-Twin-Anwendungen
• Erfahrung in der Entwicklung von Skripten und Pipelines zur Datenintegration und Echtzeitkommunikation-Dokumentation
• Erfahrung im Bereich Maschinelles Lernen zur Detektion von hochauflösenden Signalen
• Programmierung & Analyse: Python (NumPy, Pandas, Matplotlib, Seaborn, SciPy, scikit-learn), R (tidyverse, ggplot2), SQL
• Datenanalyse & Tools: Dashboard-Erstellung (Superset), Datenvisualisierung, statistische Modellierung, REDCap-Datenbankmanagement
• Cloud & Systeme: Linux, Git, Docker, AWS
• NGS & Bioinformatik: FASTQ, BAM, VCF, Variant Calling, Annotation, Single-Cell RNA-seq (Seurat, Scanpy)
• Wünschenswert ist eine PhD-Bereitschaft
• Ausgeprägte Teamfähigkeit und hohe Flexibilität verbunden mit einem herausragenden Engagement
• Empathie gegenüber Patientinnen / Patienten und Angehörigen
• Sehr gute Kommunikationsfähigkeiten in Deutsch und Englisch

Wünschenswert:

• Erfahrungen mit Echtzeitdaten, Sensordaten oder Streaming-Plattformen
• Kenntnisse in der Modellierung oder Simulation biologischer Systeme (z. B. Systembiologie, physiologische Modelle)
• Vertrautheit mit Cloud- oder Edge-Computing-Infrastrukturen
• Grundverständnis von Netzwerktechnologien (z. B. 5G/6G-Kommunikation)
• Erste Erfahrung in Forschungsprojekten mit medizinischem oder technologischem Schwerpunkt

Das bringt die Charité mit

• Eine spannende Tätigkeit an der Schnittstelle von Biomedizin, KI und KommunikationstechnologienMitarbeit in einem interdisziplinären und national sichtbaren Innovationscluster
• Möglichkeit, modernste 6G-Technologien aktiv in die Medizin der Zukunft zu überführen
• Exzellente technische Infrastruktur und enge Zusammenarbeit mit führenden Forschungsinstituten (z. B. Fraunhofer HHI)
• Weiterbildungsmöglichkeiten und aktive Unterstützung bei wissenschaftlichen Qualifikationen (Promotion möglich)
• Der Mitarbeiterin / dem Mitarbeiter wird nach §110 BerlHG Zeit für die eigene wissenschaftliche Qualifikation zur Verfügung gestellt

Informationen zur Stelle

• Entgeltgruppe E13 TVöD. Hier finden Sie alle Informationen zum Gehalt und Tarifvertrag
• Teilzeitstelle mit 30,8 Wochenstunden
• Die Position ist bis zum 31.12.2027 befristet, da sie an die Projektlaufzeit gebunden ist
• Bei uns sind 30 Tage Urlaub Standard
• Die Bewerbungsfrist endet am 21.01.2026
• Kennziffer 6065