Arbeiten an der Charité

Das Projekt richtet sich auf die Entschlüsselung molekularer Netzwerke, die die zelluläre Seneszenz überwinden, einen natürlichen Schutzmechanismus, der die Proliferation von präkanzerösen Zellen verhindert. Mithilfe globaler Transposon-Mutagenese induzieren wir eine maligne Transformation in gesunden B-Zellen mit einem Wildtyp- oder seneszenz-inkompetenten genomischen Hintergrund. Die Sequenzierung des Pools von Transposon-Insertionen ermöglicht es uns, die treibende Kraft der Lymphomagenese und die Mechanismen der Seneszenz-Inaktivierung zu analysieren. Wir untersuchen außerdem, wie sich dieses Mutationsnetzwerk unter Therapie entwickelt, um molekulare Abhängigkeiten zu finden, die die Therapieresistenz überwinden können. Wir setzen komplexe In-vitro- und In-vivo-Modellsysteme, genetische Perturbationen, Lineage-Tracing und Einzelzelltechnologien ein, um die unterschiedlichen Wege der Tumorevolution und die Mechanismen der Therapieresistenz zu untersuchen.

Die Stelle im Überblick

• Durchführung von Bioinformatik-Analysen von Bulk- und Einzelzell-RNAseq, DNA-Sequenzierung
• Analysen von Transposon-Insertionen und CRISPR-Screen-Bibliotheken unter Verwendung bestehender Bioinformatik-Pakete und -Pipelines
• Integration dieser Datensätze mit eigenen oder öffentlichen Daten zu molekularen, phänotypischen (z. B. Histologie, FACS), Wirkstoff-Screening- und klinischen Informationen
• Mitwirkung beim Aufbau von Bioinformatik-Plattformen und der Entwicklung neuer Pipelines
• Sicherstellung einer ordnungsgemäßen wissenschaftlichen Dokumentation

Danach suchen wir

• Mehrjährige berufliche Erfahrung in der Bioinformatik, Datenwissenschaft, Systembiologie oder verwandten Fachgebieten mit nachweislichem Interesse an den Lebenswissenschaften
• Umfangreiche Erfahrung mit R und Python für Data Science
• Proaktive Arbeitshaltung und Bereitschaft, modernste informatische Ansätze zu erlernen, anzuwenden und weiterzuentwickeln
• Teamgeist und Kommunikationsfähigkeiten in multifunktionalen Teams mit Experten aus anderen Fachbereichen
• Fließende Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Das bringt die Charité mit

• Wir suchen Sie für unsere Forschungsgruppe, die sich auf funktionelle Krebsgenomik und Therapieresistenz konzentriert
• Die Stelle ist im Forschungslabor für Hämatologie und Onkologie an der Charité in Berlin angesiedelt (Arbeitsgruppe von Dr. Maja Milanovic), das sich durch einen interdisziplinären Ansatz und eine enge Zusammenarbeit zwischen Wet-Lab- und Computerwissenschaftlern auszeichnet
• Das dynamische und internationale wissenschaftliche Umfeld bietet zahlreiche Möglichkeiten zur Interaktion mit anderen Gruppen mit Fachkenntnissen in Krebsbiologie, Immunologie, Bioinformatik oder Systembiologie sowie verschiedene Möglichkeiten zur wissenschaftlichen Weiterbildung und zum Networking
• Diese 50%-Stelle kann durch ein Partnerlabor für Krebsforschung, das technologisch gut auf das beschriebene Projekt abgestimmt ist, zu einer Vollzeitstelle ergänzt werden
• Ihnen wird nach §110 BerlHG Zeit für die eigene wissenschaftliche Qualifikation zur Verfügung gestellt

Informationen zur Stelle

• Entgeltgruppe E13 TVÖD VKA K. Hier finden Sie alle Informationen zum Gehalt und Tarifvertrag
• Arbeitszeit: Teilzeit mit 19,25 Wochenstunden (50%)
• Die Position ist bis zum 31.12.2028 befristet, da sie an die Projektlaufzeit gebunden ist
• Bei uns sind 30 Tage Urlaub Standard
• Die Bewerbungsfrist endet am: 08.02.2026
• Kennziffer: 6302