, Zentrum für Molekulare Medizin, ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Position als

Wissenschaftliche*r Mitarbeiter*in (m/w/d)
(E 13 TV-G-U)

anfangs befristet für zwei Jahre (mit der Option auf Verlängerung) zu besetzen. Die Eingruppierung erfolgt nach den Tätigkeitsmerkmalen des für die Goethe-Universität geltenden Tarifvertrages (TV-G-U).

Aufgaben :

• Mitarbeit und Leitung von WES- und Variantenanalyse- Projekten: Aufbau, Durchführung und Wartung robuster Pipelines für WES: Leseausrichtung und Qualitätskontrolle, Keimbahn-Varianzbestimmung, gemeinsames Genotyping, Rekalibrierung, Filterung und Annotation; Durchführung von Kohorten-assoziierten Tests und Belastungstests; Erstellung klarer Berichte für Kooperationspartner. Beitrag zur Varianteninterpretation durch Integration von Ressourcen wie gnomAD, ClinVar, OMIM und Gen-/Constraint- Metriken.
• Entwicklung und Erweiterung von Analysepipelines: Ausbau bestehender Workflows (Nextflow/Snakemake bevorzugt) für gezieltes DNA-Sequencing und Langzeit-Lesedaten; Ermöglichung der CNV-/Strukturvarianten- Erkennung, wo angemessen; Containerisierung von Tools und Sicherstellung der Reproduzierbarkeit auf HPC.
• Integration von Multi-Omics- und klinischen Daten: Verknüpfung der WES-Ergebnisse mit Bulk- und Einzelzell-RNA-seq, ATAC-seq, Immunrezeptor- Repertoires und kuratierten klinischen Endpunkten aus menschlichen Kohorten in der Herz-Kreislauf-Medizin. Betonung rigoroser Statistik und transparenter, versionskontrollierter Analysen.
• Kommunikation und Verbreitung: Analysen planen, Methoden dokumentieren, auf internationalen Tagungen präsentieren und in begutachteten Fachzeitschriften veröffentlichen, in enger Zusammenarbeit mit dem PI und klinischen Partnern.

Voraussetzungen :

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master) in Bioinformatik, Biostatistik, Informatik oder einem verwandten Fachgebiet sowie abgeschlossene Dissertation
• Praktische Erfahrung mit WES/Vollgenom- Varianterkennung und nachgelagerter Analyse (z. B. BWA/Minimap2, GATK, DeepVariant, bcftools; VEP/ANNOVAR für Annotation; Burden- und Rare-Variant-Association- Tests).
• Fundierte Kenntnisse in Python und/oder R für Datenaufbereitung, Statistik und Visualisierung; Erfahrung mit Unix/Shell und Versionskontrolle (git). Erfahrung mit Workflows (Nextflow oder Snakemake) ist von Vorteil.
• Vertrautheit im Umgang mit klinischen Human-Daten, grundlegender Phänotyp-Modellierung und bewährten Praktiken für Datensicherheit und Governance (GDPR-konforme Workflows). Erfahrung in der Zusammenarbeit mit Klinikern ist ein Plus.
• zusätzliche Fähigkeiten: Einzelzell- Analyse (Seurat/Scanpy), Analyse von Immunrezeptoren, Verarbeitung von Langsequenzen, Cloud/HPC, Containerisierung (Docker/Singularity)
• Organisations- und Teamfähigkeit, Flexibilität, Aufgeschlossenheit, Kommunikationsfähigkeit
• sehr gute Englischkenntnisse

Wir bieten:

• interessante und hochrelevante Forschungsprojekte
• ein breites Methodenspektrum, einschließlich experimenteller kardiovaskulärer Modelle und modernster Techniken
• sehr gute Forschungs- und Weiterbildungsmöglichkeiten im Bereich molekularbiologischen Techniken, Kardiologie und kardiovaskulärer Medizin
• ein abwechslungsreiches, kreatives Forschungsumfeld und eine sehr gute Ausstattung
• ein attraktiver Tarifvertrag (TV-G-U) und betriebliche Altersvorsorge
• das LandesTicket Hessen: derzeit kostenfreie Nutzung des Öffentlichen Personennahverkehrs in Hessen

Wir suchen hochmotivierte, neugierige und interaktive Kandidaten für unser interdisziplinäres Team. Neben einer sehr guten Ausstattung bieten wir sehr gute Fortbildungsmöglichkeiten und ein abwechslungsreiches, kreatives Forschungsumfeld.

Ihre Bewerbung mit den üblichen Unterlagen bestehend aus Lebenslauf, Motivationsschreiben sowie zwei Referenzen richten Sie bitte bis 11.02.2026 in einem PDF-Dokument an: Prof. Dr. Wesley Abplanalp/Prof. Dr. Andreas Zeiher, Institut für Kardiovaskuläre Regeneration, Zentrum für Molekulare Medizin, Goethe-Universität Frankfurt, Theodor-Stern-Kai 7, 60590 Frankfurt am Main, E-Mail: abplanalp

Bitte reichen Sie keine Originale ein, da die Bewerbungsunterlagen nicht zurückgeschickt werden können.