Dr. Helge Stark
Fähigkeiten und Kenntnisse
Werdegang
Berufserfahrung von Helge Stark
- Verarbeitung, Qualitätskontrolle und Analyse von humanassoziierten klinischen und Omics-Daten (insbesondere Transkriptomik) aus verschiedenen Kohorten mit Tausenden von Patienten („Humanomics“) - Entwurf und Implementierung neuer Workflows und Tools für „Humanomics“-bezogene Prozesse - Analyse von „Humanomics“-Genotypisierungs- und Transkriptomik-Daten (einschließlich eQTL, TWAS) - Kollaborative Entwicklung der PanHunter-Softwareumgebung - Beratung von Projektteams bei strategischen Entscheidungen
Teamleitung innerhalb einer dynamischen Matrixstruktur
- Verarbeitung, Qualitätskontrolle und Analyse von humanassoziierten klinischen und Omics-Daten (insbesondere Transkriptomik) aus verschiedenen Kohorten mit Tausenden von Patienten („Humanomics“) - Entwurf und Implementierung neuer Workflows und Tools für „Humanomics“-bezogene Prozesse - Analyse von „Humanomics“-Genotypisierungs- und Transkriptomik-Daten (einschließlich eQTL, TWAS) - Kollaborative Entwicklung der PanHunter-Softwareumgebung - Beratung von Projektteams bei strategischen Entscheidungen
- 3 Jahre und 10 Monate, Sep. 2017 - Juni 2021Medizinische Hochschule Hannover
Postdoctoral Researcher / Bioinformatician (Institut für Pathologie)
- MachineLearning sowie statistische Auswertung von NGS-Daten (Epigenomics, Transkriptomics) in R, Python - Datenintegration (ETL-Prozess) in Zusammenarbeit mit lokaler Biobank und lokalem Datawarehouse - Netzwerkanalysen in Gephi - Verfassen wissenschaftlicher Texte
- 4 Jahre, Sep. 2013 - Aug. 2017
PhD Student
TU Braunschweig, Abteilung für Bioinformatik
Metabolische Modellierung, Software-Entwicklung, Lehre (Python, Linux, Steady-state modelling)
- 2012 - 2013
Studentische Hilfskraft (Bioinformatik)
TU Braunschweig
Abteilung für Bioinformatik und Biochemie: Erstellung von Software zum Ausgleich biochemischer Reaktionen
- 2011 - 2011
Studentische Hilfskraft (mikrobielle Proteomik)
TU Braunschweig
Abteilung für Mikrobielle Proteomik: Laboreinrichtung, Massenspektrometrie, Auswertung von Massenspektrometrie-Daten
Ausbildung von Helge Stark
- 4 Jahre, Sep. 2013 - Aug. 2017
Bioinformatik
TU Braunschweig
Metabolische Modellierung, Bioinformatik
- 1 Jahr und 11 Monate, Okt. 2011 - Aug. 2013
Biologie
TU Braunschweig
Schwerpunkte: Systembiologie, Bioinformatik, Modellierung von Mikroorganismen
- 3 Jahre, Okt. 2008 - Sep. 2011
Biologie
TU Braunschweig
Schwerpunkte: Biochemie, Molekularbiologie, pflanzliche Zellbiologie, Lokalisierungsstudien
Sprachen
Deutsch
Muttersprache
Englisch
Fließend
Französisch
Grundlagen
Spanisch
Grundlagen
Chinesisch
Grundlagen
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