Postdoktorand*in (m/w/d)

in der Klinik und Poliklinik III im Bereich Metabolisch Vaskuläre Medizin

Die Stelle ist zum 01.11.2025 in Voll- und Teilzeit für zunächst 3 Jahre befristet zu besetzen. Die Vergütung erfolgt nach den Eingruppierungsvorschriften des Tarifvertrages für den öffentlichen Dienst der Länder(TV-L) und ist bei Vorliegen der persönlichen Voraussetzungen in die Entgeltgruppe E13 TV-L möglich.

Die Forschungsgruppe von Herrn Prof. Dr. Nikolaos Perakakis sucht eine hochmotivierte und talentierte Postdoktorand*in (maximal 6 Jahre nach Erwerb des Doktorgrades), die unser interdisziplinäres Team an der Technischen Universität Dresden verstärken möchte. Unser Fokus liegt auf der Integration von Multi-Omics-Daten, um Stoffwechselerkrankungen (z. B. Adipositas, Diabetes, metabolisch-assoziierte Steatoseerkrankungen der Leber) besser zu verstehen, zu diagnostizieren und zu behandeln.

Unsere Gruppe ist Teil einer lebendigen wissenschaftlichen Gemeinschaft an der TU Dresden und arbeitet eng mit nationalen und internationalen Partnern zusammen – unter anderem im Rahmen des Deutschen Zentrums für Diabetesforschung (DZD) und der TransCampus-Initiative mit dem King's College London. Wir analysieren große klinische Kohorten und experimentelle Modelle, um Krankheitsmechanismen zu entschlüsseln und neue Biomarker zu identifizieren – durch die Integration von Proteomik-, Metabolomik- sowie Genomik-/Transkriptomik-Daten unter Einsatz von Methoden des maschinellen Lernens.

Ihre Aufgaben:

• Integration von Multi-Omics-Daten und Durchführung fortgeschrittener statistischer Analysen in laufenden und neu gestarteten Projekten zu Stoffwechselerkrankungen

• Entwicklung und Anwendung von Modellen des maschinellen Lernens zur Biomarker-Identifikation, Patient*innen-Stratifizierung und Vorhersage von Krankheitsverläufen

• Zusammenarbeit mit Kliniken, Bioinformatiker*innen, Systembiolog*innen und experimentell arbeitenden Forschenden in einem stark interdisziplinären Umfeld

• Veröffentlichung von Forschungsergebnissen in hochrangigen wissenschaftlichen Zeitschriften und Präsentation auf nationalen und internationalen Konferenzen

• Mitbetreuung von Doktorand*innen und Nachwuchsforschenden

Passt perfekt - Ihr Profil:

• Promotion in Bioinformatik, Systembiologie, Biostatistik oder einem verwandten Fachgebiet – (der Doktorgrad sollte nicht vor 2020 erworben worden sein)

• nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Multi-Omics-Daten (Proteomik, Metabolomik und/oder Genomik, Transkriptomik)

• fundierte Kenntnisse in maschinellem Lernen und fortgeschrittener statistischer Modellierung

• sehr gute Programmierkenntnisse in Python und/oder R sowie Erfahrung mit Bibliotheken für maschinelles Lernen und Omics-Analysen (z. B. scikit-learn, TensorFlow/PyTorch, Bioconductor)

• Erfahrung mit klinischen und/oder biomedizinischen Daten ist sehr wünschenswert

• Kenntnisse im Bereich Immunologie und Erfahrung mit FACS-Analysen sind von Vorteil

• sehr gute Publikationsleistung in relevanten Fachgebieten

• Fähigkeit zur selbstständigen Arbeit sowie zur Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team sowie ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Überzeugt auf ganzer Linie - unser Angebot:

• ein inspirierendes und kooperatives Forschungsumfeld an der Technischen Universität Dresden, dem Paul Langerhans Institut Dresden (PLID) – Teil des Deutschen Zentrums für Diabetesforschung (DZD) – sowie der TransCampus-Initiative

• Zugang zu umfangreichen, gut charakterisierten klinischen Kohorten und experimentellen Modellen

• Möglichkeiten zur Mitgestaltung translationaler Spitzenforschung mit direktem Nutzen für Patient*innen mit Stoffwechselerkrankungen

• Angebote zur beruflichen Weiterentwicklung, Mentoring und zum wissenschaftlichen Networking

• Vergütung:nach TV-L sowie eine feste Jahressonderzahlung und eine betriebliche Altersvorsorge

• Erholungsurlaub:30 Tage, Weihnachten und Silvester sind ebenfalls frei, wenn sie auf einen Wochentag fallen

• Vereinbarkeit von Familie und Beruf:unser Familienbüro berät und unterstützt in jeder Lebenslage, u. a. bei Kita-Belegplätzen rund um das Klinikum, Ferienprogrammen oder der Pflege von Angehörigen

• Gesundheit:umfangreiche Sport- und Bewegungsangebote in unserem topmodernen Fitnessstudio sowie Programme und Beratung zur mentalen Gesundheit, betriebliches Gesundheitsmanagement u. v. m.

• Einkaufsvorteile:Mitarbeiterrabatt in unserer Klinikapotheke, Corporate Benefits und weitere Shoppingportale

• Mobilität:Zuschuss zum Job-Ticket und Möglichkeit eines Stellplatzes in unserem Parkhaus oder innerhalb des Klinikgeländes

• Promotion in Bioinformatik, Systembiologie, Biostatistik oder einem verwandten Fachgebiet – (der Doktorgrad sollte nicht vor 2020 erworben worden sein)

• nachgewiesene Erfahrung in der Analyse von Multi-Omics-Daten (Proteomik, Metabolomik und/oder Genomik, Transkriptomik)

• fundierte Kenntnisse in maschinellem Lernen und fortgeschrittener statistischer Modellierung

• sehr gute Programmierkenntnisse in Python und/oder R sowie Erfahrung mit Bibliotheken für maschinelles Lernen und Omics-Analysen (z. B. scikit-learn, TensorFlow/PyTorch, Bioconductor)

• Erfahrung mit klinischen und/oder biomedizinischen Daten ist sehr wünschenswert

• Kenntnisse im Bereich Immunologie und Erfahrung mit FACS-Analysen sind von Vorteil

• sehr gute Publikationsleistung in relevanten Fachgebieten

• Fähigkeit zur selbstständigen Arbeit sowie zur Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team sowie ausgezeichnete Englischkenntnisse in Wort und Schrift

• ein inspirierendes und kooperatives Forschungsumfeld an der Technischen Universität Dresden, dem Paul Langerhans Institut Dresden (PLID) – Teil des Deutschen Zentrums für Diabetesforschung (DZD) – sowie der TransCampus-Initiative

• Zugang zu umfangreichen, gut charakterisierten klinischen Kohorten und experimentellen Modellen

• Möglichkeiten zur Mitgestaltung translationaler Spitzenforschung mit direktem Nutzen für Patient*innen mit Stoffwechselerkrankungen

• Angebote zur beruflichen Weiterentwicklung, Mentoring und zum wissenschaftlichen Networking

• Vergütung:nach TV-L sowie eine feste Jahressonderzahlung und eine betriebliche Altersvorsorge

• Erholungsurlaub:30 Tage, Weihnachten und Silvester sind ebenfalls frei, wenn sie auf einen Wochentag fallen

• Vereinbarkeit von Familie und Beruf:unser Familienbüro berät und unterstützt in jeder Lebenslage, u. a. bei Kita-Belegplätzen rund um das Klinikum, Ferienprogrammen oder der Pflege von Angehörigen

• Gesundheit:umfangreiche Sport- und Bewegungsangebote in unserem topmodernen Fitnessstudio sowie Programme und Beratung zur mentalen Gesundheit, betriebliches Gesundheitsmanagement u. v. m.

• Einkaufsvorteile:Mitarbeiterrabatt in unserer Klinikapotheke, Corporate Benefits und weitere Shoppingportale

• Mobilität:Zuschuss zum Job-Ticket und Möglichkeit eines Stellplatzes in unserem Parkhaus oder innerhalb des Klinikgeländes