Vor 22 Stunden veröffentlicht

Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)

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Universitätsklinikum Erlangen

Krankenhäuser

Erlangen

  • Art der Anstellung: Vollzeit
  • 56.000 € – 74.500 € (von XING geschätzt)
  • Vor Ort
  • Zu den Ersten gehören

Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)

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Über diesen Job

Data Scientist (m/w/d) / Bioinformatiker (m/w/d)

Stammzellbiologie
38.5 Stunden
auf 36 Monate befristet
ab 01.10.2025
Eingruppierung gemäß TV-L
Bewerbungsfrist 30.09.2025


Telefon: 09131 85-42840

Das sind wir:

Das Universitätsklinikum Erlangen steht für exzellente Patientenversorgung, innovative Forschung und eine hochwertige medizinische Ausbildung. Mit über 9.800 qualifizierten Mitarbeitenden zählt das Klinikum zu den größten Arbeitgebern in Mittelfranken und trägt durch kontinuierliche Weiterentwicklung maßgeblich zum medizinischen Fortschritt bei.

Im Rahmen des Transregio-Forschungsverbunds TRR 417 "Zelluläre Kommunikation im Stroma des kolorektalen Karzinoms: Von der Pathophysiologie bis zur klinischen Translation" kooperieren die Universitätskliniken Erlangen, Frankfurt und Freiburg intensiv. Ziel des Verbunds ist es, die komplexen Interaktionen im Tumormikromilieu des kolorektalen Karzinoms eingehend zu erforschen und innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Durch diese interdisziplinäre Spitzenforschung schaffen die beteiligten Universitätskliniken die wissenschaftliche Grundlage für verbesserte Behandlungsmöglichkeiten sowie eine nachhaltige Optimierung der Versorgung von Patientinnen und Patienten mit kolorektalem Karzinom. Gestalten Sie mit uns gemeinsam die Zukunft der Medizin und werden Sie Teil unseres engagierten Teams.

Die Aufgaben

  • Forschungsdatenmanagement (RDM) gemäß FAIR-Prinzipien zur Sicherstellung langfristiger Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit
  • Bioinformatische Analyse und Integration von Single-Cell-, Bulk-RNA-seq-, Metabolomics und weiteren Omics-Datensätzen im Rahmen des TRR417
  • Entwicklung und Anwendung statistischer Methoden zur Auswertung großskaliger biologischer Datensätze
  • Visualisierung und Interpretation komplexer molekularbiologischer Ergebnisse in enger Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern
  • Erstellung und Veröffentlichung wissenschaftlicher Publikationen sowie Präsentation der Ergebnisse auf internen und externen Fachveranstaltungen
  • Das Know-how dafür

  • Abgeschlossenes Studium (Master oder Promotion) in Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder einer verwandten Fachrichtung
  • Vertraut mit den FAIR-Prinzipien und deren praktischer Umsetzung
  • Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards (z. B. MIAME, MINSEQE, OME)
  • Praxis in Datenversionierung (z. B. Git) und Workflow-Management (z. B. Snakemake, Nextflow)
  • Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten (z. B. RNA-seq, Single-Cell Omics)
  • Sicherer Umgang mit Python und/oder R sowie gängigen Bioinformatik-Frameworks (z. B. Scanpy, Seurat, Bioconductor)
  • Vertiefte Kenntnisse in Statistik und Machine Learning, idealerweise mit Erfahrung in Graph Neural Networks (GNNs)
  • Ausgeprägte Teamfähigkeit, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit
  • Gehalts-Prognose

    Unternehmens-Details

    company logo

    Universitätsklinikum Erlangen

    Krankenhäuser

    5.001-10.000 Mitarbeitende

    Erlangen, Deutschland

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