Als Public-Health-Institut setzen wir uns aktiv für die Gesundheit der Bevölkerung in Deutschland ein. Daran arbeiten und forschen im Robert Koch-Institut jeden Tag gemeinsam 1.500 Menschen aus über 52 Nationen.

Unser Team FG 13 freut sich auf Ihre Bewerbung!

Am Standort Wernigerode widmen wir uns der Erforschung von Antibiotikaresistenzen, einschließlich ihres Nachweises in Abwasserproben. Unser Team arbeitet interdisziplinär und setzt dabei auf modernste mikrobiologische und molekularbiologische Methoden sowie innovative Hochdurchsatz-Sequenzierungstechnologien.

Ihre Aufgabe bei uns

• Mitarbeit an Forschungsprojekten zur Untersuchung antimikrobieller Resistenzen (AMR) in Abwasserproben
• Durchführung und methodische Weiterentwicklung mikrobiologischer und molekularbiologischer Analysen sowie moderner Sequenzierungstechnologien
• Arbeit mit klinisch relevanten mikrobiellen Krankheitserregern, insbesondere gramnegativen Pathogenen, unter Anwendung molekularbiologischer Methoden und komplexer bioinformatischer Auswertungen
• Planung, Implementierung und kontinuierliche Optimierung bioinformatischer Analysen und Auswertungstools für Daten aus Hochdurchsatztechnologien in enger Zusammenarbeit mit internen und externen Arbeitsgruppen
• Vertretung des Themenfelds in internen und externen Arbeitsgruppen
• Planung, Beantragung und unmittelbare Betreuung und Durchführung von Forschungsprojekten
• Verfassen wissenschaftlicher Publikationen
• Betreuung von wissenschaftlichem Personal (Bachelor-, Master-, und Promotionsstudierenden)

Ihr Profil

Formale Voraussetzungen

• abgeschlossenes Hochschulstudium (Master oder äquivalent) in Biologie, Biochemie, Biotechnologie, Humanbiologie, Medizin, Veterinärmedizin oder einem vergleichbaren Fach
• Promotion ist von Vorteil

Bei ausländischen Bildungsqualifikationen benötigen wir einen Nachweis über die Gleichwertigkeit mit einem deutschen Abschluss.

Kenntnisse und Erfahrungen

• im bakteriologisch-wissenschaftlichen Arbeiten und mit molekularbiologischen Hochdurchsatztechniken
• in der Analyse von Mikrobiom- und Metagenom-Daten, einschließlich Sequenzierungsdaten (z. B. 16S rRNA und Shotgun-Metagenomik)
• in der Anwendung von Programmen und Tools zur Analyse von komplexen Daten aus Hochdurchsatztechniken
• im Einwerben von Drittmitteln und Betreuung von Forschungsprojekten
• eigenständiges nachweisbares wissenschaftliches Profil ("track record") durch Publikationen und ggf. eingeworbene Drittmittel
• im sicheren Umgang mit den gängigen MS Office-Programmen
• Sprachkenntnisse (CEFR-Niveau): Deutsch mind. C1, Englisch mind. B2

Wünschenswert Erfahrungen

• in Sequenzierung und Phylogenomics-Analysen bakterieller Pathogene, einschließlich Genomvergleich
• im Umgang mit Bioinformatik-Tools und Programmiersprachen zur Analyse von Metagenom- und Mikrobiomdaten (z. B. QIIME2, Kraken2, MEGAHIT, R, Python)
• in der Gewinnung, Bearbeitung und Bewertung komplexer biologischer und bioinformatischer Daten sowie der Digitalisierung wissenschaftlicher Arbeitsabläufe
• im experimentellen und bioanalytischen Arbeiten im Bereich von Expressionsstudien und mikrobiologisch-biotechnologischen Methoden (z. B. Klonierung, Mutagenese) in der Arbeit mit Pathogenen der Sicherheitsstufe 2

Persönliche Kompetenzen

• Eigeninitiative und die Bereitschaft neue Aufgaben zu übernehmen
• Belastbarkeit durch flexibles, gelassenes Handeln in schwierigen Situationen
• Selbständigkeit und eigenes Arbeiten nach Zielvorgaben
• Kommunikationsfähigkeit und ein zuvorkommendes, freundliches und wertschätzendes Verhalten gegenüber anderen
• Kritikfähigkeit durch angemessenes und konstruktives Feedback
• Kooperations- und Teamfähigkeit und eine vertrauenswürdige und verlässliche Zusammenarbeit