Das GQS-Hauptstadtbüro in Berlin-Mitte (Wöhlertstraße 4, 10115 Berlin) verbindet das Headquarter mit der deutschen Bundeshauptstadt. An zentralem Standort steht ein Tagungs- und Schulungsraum mit multimedialer Tagungstechnik sowie mehrere moderne Büroräume mit komplettem technischem Anschluss an das Headquarter in Stuttgart zur Verfügung. Von hier werden Dopingkontrollen in und rund um die „deutsche Sporthauptstadt“ – insbesondere bei Großveranstaltungen – koordiniert und gesteuert.