Anastasia Dekker

Labor von Prof. Dr. Dr. Philipp Schommers Thema: Detection of Antibody Resistance in the HIV-1 Reservoir - Durchführung experimenteller Arbeiten mit HIV-1 Material unter BSL-3 Sicherheitsbedingungen - Isolierung von gDNA aus Patienten-PBMCs und Amplifikation von HIV-1 envelope Sequenzen mittels Nested PCR - Generierung von Env-pseudotypisierten Viren sowie Durchführung von Neutralisationsassays - Produktion und Aufreinigung rekombinanter Antikörper über Affinitätschromatographie und Ultrafiltration

Forschungspraktikum im Labor von Prof. Dr. Dr. Schommers Thema: CRISPR/Cas9 Luciferase Knock-In for Cytotoxicity Screening - Generierung und Optimierung eines Luciferase-Reporterkonstrukts mittels PCR und SLIC-Klonierung - Transfektion von B-Zell Lymphomzelllinien und Etablierung einer stabilen Reporterzelllinie - Validierung der erfolgreichen Integration des Reporter-Systems durch genomische PCR

Forschungspraktikum im Labor von Dr. Steger Thema: Modulation of EGFR Signalling by the HPV8 E6 Oncoprotein - Transiente Transfektion humaner Krebszelllinien mit FLAG-markierten Konstrukten mittels Calciumchlorid-Präzipitation - Untersuchung von Proteininteraktionen/-expression mittels Co-Immunpräzipitation und Western Blot - Klonierung von HPV8-E6-Wildtyp und -Mutanten in einen SBP-markierten Expressionsvektor mittels Restriktionsklonierung zur Analyse funktioneller Domänen

- Genotypisierung von Mausproben mittels PCR und Agarose-Gelelektrophorese - Durchführung von siRNA-Knockdowns mittels Lipofectamine-Transfektion zur Unterstützung laufender Gene-Silencing-Experimente - Einarbeitung und Betreuung neuer Studierender bezüglich Laborprotokollen und Arbeitsabläufen

- Sicherstellung des Laborbetriebs durch Vorbereitung steriler Verbrauchsmaterialien, Medien und Puffer - Kultivierung von Säugerzellkulturen unter sterilen Bedingungen, einschließlich Passagieren und Zellzählung - Durchführung von qPCR-Analysen zur Quantifizierung von Veränderungen der Genexpression

Labor von Prof. Dr. Martin Sos, Translationale Genomik Thema: Characterisation of DNA Damage Response signalling under therapeutic stress in Small Cell Lung Cancer - Kultivierung und Behandlung von Krebszelllinien mit therapeutischen Wirkstoffen sowie Analyse der Proteinexpression mittels Western Blot - Durchführung von Immunfluoreszenzfärbungen und Quantifizierung der Ergebnisse mittels Konfokalmikroskopie und ImageJ

Abschlussnote: 1,4 Thema der Masterarbeit: Detection of Antibody Resistance in the HIV-1 Reservoir Labor von Prof. Dr. Dr. Schommers, Zentrum für Molekulare Medizin Köln (ZMMK), Uniklinik Köln

Abschlussnote: 1,7 Schwerpunkt: Medizinische Biologie und Biochemie Thema der Bachelorarbeit: Characterisation of DNA Damage Response signalling under therapeutic stress in Small Cell Lung Cancer Labor von Prof. Dr. Sos, Translationale Genomik, Uniklinik Köln