Dr. David Wifling

Angestellt, Research Scientist - Computational Chemistry, Origenis GmbH
Abschluss: Promotion, Universität Regensburg
Ehekirchen, Deutschland

Fähigkeiten und Kenntnisse

Computational chemistry
Drug Design
Medizinische Chemie
Forschung
Pharmazie
MD simulation
HPC
Schrödinger suite
Programmiersprachen
Bash (shell)
R Programmiersprache
Python
Amber
Gromacs
PyMOL
Linux
Biochemie und Molekularbiologie
MODELLER
OpenBabel
Pharmakologie
Plumed
OpenMM
ChemAxon
KNIME
Organische Chemie
Simulation
Data Science
Machine Learning
Deep Learning
sklearn
TensorFlow
Keras
PyTorch
Statistik
Softwareentwicklung
Maschinelles Lernen
Datenanalyse
Pharmacy
Dashboards
Server
Pharmaindustrie
Git
Künstliche Intelligenz
Wirkstoff
Biomedizin
Forschung und Entwicklung
CentOS
HPLC
Spektroskopie
AI

Werdegang

Berufserfahrung von David Wifling

  • Bis heute 4 Jahre, seit März 2022

    Research Scientist - Computational Chemistry

    Origenis GmbH

    • Entwicklung und Anwendung automatisierter Tools für computergestütztes Arzneimittel-Design. • Automatisierte Generierung von Machine Learning-basierten QSPR-Modellen zur Vorhersage der Eigenschaften von Arzneimittelkandidaten. • Entwicklung von Deep-Learning-Frameworks für Aufgaben wie Nomenklaturkorrektur (NLP). • Mitwirkung an Projekten zur rationalen Arzneimittelentwicklung in interdisziplinären Teams (Chemie, Biologie, Pharmakologie). • Wartung und Betrieb des firmeneigenen Rechenclusters.

  • 2 Jahre und 2 Monate, Jan. 2020 - Feb. 2022

    Computational | Data Scientist

    Leibniz Supercomputing Centre (LRZ)

    • Projektarbeit im CompBioMed2 Center of Excellence (EU H2020) zur Entwicklung und Nutzung computergestützter Methoden in der Biomedizin. • Leitung des Arbeitspakets 3 „Data Management and Analytics“ sowie des Tasks 4.6 „Route to the Exascale“. • Entwicklung der CompBioMed2 Benchmark Suite mit hochskalierbaren Anwendungen (MD-Codes wie AMBER, GROMACS, OpenMM, NAMD und LAMMPS). • Durchführung von Kursen im Bereich computergestützte Biomedizin wie „Molecular visualisation using PyMOL“.

  • 4 Jahre und 9 Monate, Apr. 2015 - Dez. 2019

    Postdoctoral Researcher in Computational Chemistry

    Universität Regensburg

    • Forschungsprojekte zu G-Protein gekoppelten Rezeptoren (GPCR) und ABC-Transportern: Struktur-basiertes Wirkstoffdesign zur Entwicklung hoch-affiner, selektiver Verbindungen. • Molekulardynamik-Simulationen (μs) zur Aufklärung von Ligand-Rezeptor-Interaktionen und Untersuchung des molekularen Mechanismus basaler GPCR-Aktivität. • Assoziierter Wissenschaftler im Graduiertenkolleg GRK 1910 der DFG. • Aufbau und Wartung eines GPU-Clusters und Nutzung von HPC-Clustern in Erlangen und München (SuperMUC)

  • 6 Monate, Mai 2010 - Okt. 2010

    Pharmaziepraktikant

    St. Josefs Apotheke

Ausbildung von David Wifling

  • 1 Monat, Juli 2011 - Juli 2011

    Pharmazie

    Universität Regensburg

  • 4 Jahre und 5 Monate, Nov. 2010 - März 2015

    Medicinal chemistry

    Universität Regensburg

    • Anwendung von Methoden aus Molekularbiologie, Biochemie, Molekularpharmakologie und Molekularmodellierung. • Dissertationsthema: „Constitutive activity of the human histamine H4 receptor: Molecular modelling, binding and functional studies on wild type and mutant H4R orthologs“

  • 5 Jahre und 10 Monate, Okt. 2005 - Juli 2011

    Pharmazie

    Universität Regensburg

    Studium der Pharmazie einschließlich der Ausbildung in den persönlich bevorzugten Fächern wie Medizinische Chemie, Pharmakologie, Biochemie, Organische Chemie und Chemische Analyse.

Sprachen

  • Englisch

    Fließend

  • Deutsch

    Muttersprache

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