Dr. Sören Wacker
Fähigkeiten und Kenntnisse
Werdegang
Berufserfahrung von Sören Wacker
- Bis heute 3 Jahre und 2 Monate, seit Okt. 2023
Senior Research Software and HPC Engineer
Technische Universität Delft
Research Engineer und technischer Berater für CropXR, ein Konsortium für klimaresistente Nutzpflanzen. Aufbau und Betrieb von ResilienceHub, der Forschungsdatenplattform des Konsortiums, auf Kubernetes mit GitOps, genutzt von vier Universitäten. Metaseed: Entwurf und Entwicklung eines schemabasierten Werkzeugs für wissenschaftliche Metadatenstandards mit CLI, Weboberfläche, Python-API und MCP-Server sowie der Mehrbenutzer-Webanwendung Metaseed Hub.
- 4 Jahre und 6 Monate, Apr. 2019 - Sep. 2023
Team Lead Data Science
University of Calgary
Leitung des Data-Science-Teams für den weltweit größten mikrobiellen Multi-Omics-Datensatz: 35.000 Proben aus Genomik, Proteomik und Metabolomik, 100 TB. Entwicklung von LAMPrEY, einer automatisierten Qualitätskontrolle für Proteomikdaten, die den QC-Aufwand der Wissenschaftler um 98 Prozent senkte. Entwicklung von ms-mint-app für großskalige Metabolomik. Betreuung von Doktoranden. Technischer Berater des Start-ups Fluidome.
- 1 Jahr und 1 Monat, Apr. 2018 - Apr. 2019
Research Associate
University of Calgary
Entwicklung von ms-mint, einer Python-Bibliothek für skalierbare zielgerichtete Metabolomik. Betreuung von Doktoranden durch Code-Reviews und persönliche Unterstützung. Deep-Learning-Methoden für verschiedene wissenschaftliche Datensätze. Pflege des GitHub-Repositorys des Noskov Lab.
- 1 Jahr und 4 Monate, Jan. 2017 - Apr. 2018
Freelancer
Sören Wacker Data Science
- 2 Jahre und 7 Monate, März 2014 - Sep. 2016
Postdoctorand
University of Calgary
Selbstständige Forschung im Bereich Medikamentenentwicklung mit methodischem Fokus auf Machine Learning
- 2 Jahre und 3 Monate, Apr. 2014 - Juni 2016
Postdoktorand
University of Calgary, Centre for Molecular Simulation
Mitgründung von Achlys Inc. (maschinelles Lernen für die Wirkstoffforschung) mit dem Li Ka Shing Institute. Machine-Learning-Modell zur Vorhersage der kardialen Toxizität von Wirkstoffkandidaten, mit Patentanmeldung. Top 10 Prozent im Kaggle-Wettbewerb "Rossmann Store Sales" mit XGBoost.
- 1 Jahr und 6 Monate, Aug. 2012 - Jan. 2014
Postdoctorand
Max Planck Institut für biophysikalische Chemie
Ausbildung von Sören Wacker
- 3 Jahre und 8 Monate, Jan. 2009 - Aug. 2012
Theoretische Biophysik und molekulare Simulationen
Georg-August Universität Göttingen
Computer Simulationen von Bio-Molekülen, Vorhersage von Medikamentenwirksamkeit, Python Programmierung
- 6 Jahre und 3 Monate, Okt. 2002 - Dez. 2008
Physik
Georg-August Universität Göttingen
Bio-Physik, Theoretische Physik
Physik
Leibniz Universität Hannover
Sprachen
Deutsch
C2 (Verhandlungssicher / Muttersprachlich)
Englisch
C1 (Fließend)
Französisch
A1-A2 (Grundkenntnisse)
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