Das Universitätsklinikum Erlangen steht für exzellente Patientenversorgung, innovative Forschung und eine hochwertige medizinische Ausbildung. Mit über 9.800 qualifizierten Mitarbeitenden zählt das Klinikum zu den größten Arbeitgebern in Mittelfranken und trägt durch kontinuierliche Weiterentwicklung maßgeblich zum medizinischen Fortschritt bei.

Im Rahmen des Transregio-Forschungsverbunds TRR 417 "Zelluläre Kommunikation im Stroma des kolorektalen Karzinoms: Von der Pathophysiologie bis zur klinischen Translation" kooperieren die Universitätskliniken Erlangen, Frankfurt und Freiburg intensiv. Ziel des Verbunds ist es, die komplexen Interaktionen im Tumormikromilieu des kolorektalen Karzinoms eingehend zu erforschen und innovative Therapieansätze zu entwickeln.

Durch diese interdisziplinäre Spitzenforschung schaffen die beteiligten Universitätskliniken die wissenschaftliche Grundlage für verbesserte Behandlungsmöglichkeiten sowie eine nachhaltige Optimierung der Versorgung von Patientinnen und Patienten mit kolorektalem Karzinom. Gestalten Sie mit uns gemeinsam die Zukunft der Medizin und werden Sie Teil unseres engagierten Teams.

Die Aufgaben

• Forschungsdatenmanagement (RDM) gemäß FAIR-Prinzipien zur Sicherstellung langfristiger Datenverfügbarkeit und -nachnutzbarkeit
• Bioinformatische Analyse und Integration von Single-Cell-, Bulk-RNA-seq-, Metabolomics und weiteren Omics-Datensätzen im Rahmen des TRR417
• Entwicklung und Anwendung statistischer Methoden zur Auswertung großskaliger biologischer Datensätze
• Visualisierung und Interpretation komplexer molekularbiologischer Ergebnisse in enger Zusammenarbeit mit experimentellen Partnern
• Erstellung und Veröffentlichung wissenschaftlicher Publikationen sowie Präsentation der Ergebnisse auf internen und externen Fachveranstaltungen

Das Know-how dafür

• Abgeschlossenes Studium (Master oder Promotion) in Bioinformatik , Computational Biology , Data Science oder einer verwandten Fachrichtung
• Vertraut mit den FAIR-Prinzipien und deren praktischer Umsetzung
• Erfahrung mit biomedizinischen Daten und Metadatenstandards (z. B. MIAME, MINSEQE, OME)
• Praxis in Datenversionierung (z. B. Git) und Workflow-Management (z. B. Snakemake, Nextflow)
• Erfahrung in der Analyse von Hochdurchsatzdaten (z. B. RNA-seq, Single-Cell Omics)
• Sicherer Umgang mit Python und/oder R sowie gängigen Bioinformatik-Frameworks (z. B. Scanpy, Seurat, Bioconductor)
• Vertiefte Kenntnisse in Statistik und Machine Learning , idealerweise mit Erfahrung in Graph Neural Networks (GNNs)
• Ausgeprägte Teamfähigkeit, selbstständige und strukturierte Arbeitsweise sowie Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit

Das bieten wir:

• Einen krisensicheren Arbeitsplatz mit allen Annehmlichkeiten eines Tarifvertrages, inkl. Zusatzvorsorge der Versorgungsanstalt des Bundes und der Länder (VBL), bei uns als systemrelevanter Arbeitgeber im öffentlichen Dienst
• Eine interessante Tätigkeit in einem motivierten, aufgeschlossenen Team
• Sorgfältige und qualifizierte Einarbeitung
• Ein umfassendes Angebot zur Gesundheitsförderung
• Beabsichtigte Eingruppierung, je nach Qualifikation und persönlichen Voraussetzungen, gemäß TV-L
• Es handelt sich um eine Vollzeitstelle, diese ist grundsätzlich auch teilzeitfähig

Ansprechperson bei Fragen:

Dr. Pooja Gupta Group Leader 'Bioinformatics for Multiomics' Telefon: 09131 85-42840

Bewerbung an:

Universitätsklinikum Erlangen Abteilung Stammzellbiologie Pooja Gupta 91054 Erlangen

Bereitgestellt in Kooperation mit der Bundesagentur für Arbeit.