Nico Ahrens

• Entwicklung einer Softwarelösung zur Erkennung von Venen und Arterien in Ultraschallbildern • Verbindung von Machine Learning und traditioneller Bildverarbeitung • Semantic Image Segmentation • Computer Vision • Entwicklung im Team (Versionskontrolle nach git flow) • Übertragung des Projekts in objektorientierte Programmierung

- Anfertigung histologischer Gewebeschnitten - Immunhistochemie - Gerätewartungen - Einarbeitung von Praktikanten und Mitarbeitern - Schreiben von med. Befunden

Entwicklung einer Multiplex-PCR für ein Microarray Testsystem zur Identifizierung von Pathogenen.

- Etablierung der qPCR für den Einsatz in der Entwicklung neuer IvD Assays - Primerdesign und -analyse - Nachweis von Rhesus-Zielsequenzen mit qPCR, Sequenzanalysen mit BLAST und Geneious - Initiale Tests zu einer Longe-Range-SSP-PCR mit anschließender NGS-Sequenzierung

Thema der Arbeit: "Erstellung eines SSP-Testsystems zur Bestimmung seltener Blugruppen-Genotypen" - Auswahl der Zielregionen durch spezielle Sequenzdatenbanken (z.B. NCBI Nucleotide Database, RBC-Database) - Primerdesign (Oligoanalyzer) - Austestung und Validierung neuer Oligonukleotid-Kombinationen zur Optimierung von bestehenden IvD Reagenzien - Umfangreiche Literaturrecherche und Experimentelle Arbeiten zur Optimierung der PCR-Effiziens von strukturreichen Zielsequenzen

Inhalte: - Python - BioPython - Linux (BASH) - Objektorientierte Programmierung - Datenbankmanagement - SQL-Anbindung - NGS - Statistische Auswertung mit R / R-Studio - Machine Learning - Künstliche neuronale Netzwerke - Automatisierte Bilderkennungsverfahren