Chloé Aujoulat
Fähigkeiten und Kenntnisse
Werdegang
Berufserfahrung von Chloé Aujoulat
- 1 Jahr und 6 Monate, Juni 2024 - Nov. 2025
Bioinformatician
ERA-BIO-IT (located in Lidea Seeds France)
Construction and analysis of a maize pangenome. Pangenome construction: Minigraph, PGGB, Minigraph-Cactus. Pangenome analysis: partitioning the pangenome (Panacus), variant calling (VG deconstruct). Statistical analysis (VG stats). Filtering variants (VCFtools). Automation of workflow for the construction and analysis of pangenomes. Participation in the creation of a R&D project to submit a technical proposal: project suggestions related to pangenomic and modelisation. HPC SLURM.
- 1 Jahr und 3 Monate, Aug. 2022 - Okt. 2023
PhD Student
RWTH Aachen University
Detection and evaluation of sequence variations in the sheep poodle genome (dog) (Python, Bash, pandas and plotly). Designing pipeline using FastQC, SAMtools, BCFtools, Clustal Omega, MUSCLE, Iq-tree, and VSEARCH. Performing in silico SNP-array. Phylogenetic reconstruction. Manipulation of GEO database, Nanopore sequencing data, and Illumina SNP-probe data. Data interpretation and protocol validation. Visualization of Nanopore manipulation. Git. Statistical analysis.
- 4 Monate, Apr. 2021 - Juli 2021
Research Assistant
Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Pflanzenforschung
Metabolic modelling using Flux Balance Analysis (Python, pandas and use of Conda and plotly). Mapping of metabolites, reactions and genes using different databases (NCBI, ENSEMBL, BiGG and ModelSEED). API. Git.
- 6 Monate, Jan. 2019 - Juni 2019
Research Intern
Institut National de la Recherche Agronomique
Transient and stable transformations of tomato protoplasts, qRT-PCR, statistical analysis using R.
- 4 Monate, Apr. 2018 - Juli 2018
Laboratory Technician
Institut Jean-Pierre Bourgin
Analysis of genetic sequences, DNA extractions & PCR on Arabidopsis thaliana.
- 3 Monate, Okt. 2016 - Dez. 2016
Laboratory Technician
Institut d'Ecologie et des Sciences de l'Environnement de Paris
In vitro culture, NeuronJ manipulation, Arabidopsis thaliana, GWAS .
Sprachen
Französisch
C2 (Verhandlungssicher / Muttersprachlich)
Englisch
C1 (Fließend)
Deutsch
A1-A2 (Grundkenntnisse)
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