Dr. Martin Münsterkötter

Angestellt, DevOps Engineer for Data Science, it@M - IT-Dienstleister der Landeshauptstadt München
Munich, Germany

Fähigkeiten und Kenntnisse

Führung und Management
Laborleitung
Projektmanagement
Qualitätsmanagement
Biologische Sicherheit
Risikoanalyse
Management
Projekt-Consulting
Bildungsforschung
wissenschaftliche Vortäge und Publikationen
akademische Lehre
Betreuung von Diplom- und Promotionsarbeiten
Mykologie
Pflanzenpathologie
Pflanzenschutz
Agrarwissenschaften
Forst- und Holzwissenschaft
Datenanalyse und -integration
Standardisierung
Biostatistik
R
MatLab
Bioinformatik
Genomanalyse
Sequenzanalyse
Computational Biologie
-omics Integration
Funktionale Ontologien
MySQL
Relationale Datenbanken
Oracle
Postgres
Softwareentwicklung
Objekt orientierte Programmierung (C C++ Java)
Script-Programmierung (Perl Python)
bash-Programierung
J2EE
Java Platform
Enterprise Edition
CGI
XML
Server
Apache
Apache Tomcat
Hoch Performantes Rechnen
Systemadministration
Unix/Linux
Windows
MS Office
MS Project
C, C++, C#
Java SE
Perl
Python
SQL
PL/SQL
XSLT
CSS
JavaScript
bash-scripting
linux
iOS
Java
.NET

Werdegang

Berufserfahrung von Martin Münsterkötter

  • Current 6 years and 4 months, since Feb 2020

    DevOps Engineer for Data Science

    it@M - IT-Dienstleister der Landeshauptstadt München

    E-Akte - Fabasoft eGov Suite

  • 2 years and 11 months, Mar 2017 - Jan 2020

    Leiter Bioinformatik

    Universität Sopron, Sopron, Ungarn

    Leiter Funktional Genomanalysen und Bioinformatik am Zentrum für Forstwissenschaften und Holzindustrie

  • 9 months, Jun 2016 - Feb 2017

    Fortbildung

    alfatraining Bildungszentrum e.K.

  • 12 years and 4 months, Feb 2004 - May 2016

    Senior Bioinformatik und Computer gestützte Biologie

    Helmholtz Zentrum München, Neuherberg, Ingostädter Landstrasse 1

    Weiterentwicklung der Pilz- und Mikroben Genomanalyse • Standardisierung, Automatisierung, Durchsatz • De-novo Genomassemblierung(NGS), Transkriptionsanalyse (Mikroarray / RNAseq), -omics-Datenintegration • Einführung und Etablierung der Genomanalyse am Institut für Mikrobiologie der Bundeswehr – Prototyp: Coxiellen • Charakterisierung der Pathogen /Wirt Interaktionen • Antrag: Nachhaltiger Pflanzenschutz – Mikrobiomanalyse,Modellierung und Risikobewertung

  • 3 months, Aug 2011 - Oct 2011

    Auftragsforschung als Experte für Mikrobenannotation

    Biomax Informatics AG, Planegg, Robert-Koch-Str. 2

    Charakterisierung des Mycobacterium fortuitum Genomes

  • 4 years and 8 months, Jun 1999 - Jan 2004

    Gruppenleiter

    Max Planck Institut für Biochemie, Martiensried, Am Klopferspitz 1

    Gruppenleiter Vergleichende Pilz-Genomanalyse • Aufbau und Etablierung einer Genomforschungsresource für Pilze, Funktionale Genomannotation • Ontologien (FunCat, ComplexCat,PhenoCat) und MIPS-Protein-Interaktions-Resource (MPact)

  • 7 years, Jul 1992 - Jun 1999

    Wissenschaftlicher Mitarbeiter

    Universität München, Adolf Butenandt Institut, Molekularbiologie

    Dissertation in Biochemie am Adolf Butenandt Institut,Molekularbiologie, Universität München „Kooperative Wechselwirkungen von Transkriptionsfaktoren und Histonen mit Promotorelementen der Phosphatasegene PHO5 und PHO8 in Saccharomyces cerevisiae“ Dozemt Biochemie II für Mediziener

  • 11 months, Jun 1991 - Apr 1992

    Wissenschaftliche Hilfskraft

    Adolf Butenandt Institut, Molekularbiologie, Universität München

    Diplomarbeit am Adolf Butenandt Institut, Molekularbiologie, Universität München „Die Rolle des Positiven Regulators Pho81 bei der Expression des Gens der sauren Phosphatase PHO5 aus Saccharomyces cerevisiae“

Ausbildung von Martin Münsterkötter

  • 7 years, Jul 1992 - Jun 1999

    Biochemie

    Ludwig-Maximilians-Universität München

    Molekularbiologie, Chromatin, Transkritionelle Regulation

  • 1 year and 7 months, Nov 1989 - May 1991

    Chemie

    Ludwig-Maximilians-Universität München

    Organische Chemie, Anorganische Chemie, Physikalische Chemie, Biochemie

  • 2 years and 9 months, Oct 1986 - Jun 1989

    Chemie

    Westfälische Wilhelms-Universität, Münster

    Organische Chemie, Anorganische Chemie, Physikalische Chemie, Physik, Mathematik, Biochemie

Sprachen

  • German

    C2 (Verhandlungssicher / Muttersprachlich)

  • English

    C1 (Fließend)

  • Dutch

    B1-B2 (Gute Kenntnisse)

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