Dr. Verena Marina Prade

Das CCCM bündelt die Expertise der Universitätsklinika der LMU und TUM, sowie des Tumorzentrums München in der onkologischen Patientenversorgung und Forschung. Bundesweit sollen Zentren für Personalisierte Medizin eingerichtet und die Kompetenzen in dem Deutschen Netzwerk für Personalisierte Medizin (DNPM) gebündelt werden. Für den Münchner Standort war ich für die Arbeitsgruppe Medizininformatik zuständig und beschäftigte mich mit Fragestellungen zum Thema IT Infrastruktur, IT Sicherheit und Datenschutz.

As part of the Research Unit Analytical Pathology, I worked to advance digital pathology and offer spatially resolved high-resolution in-situ tissue analysis through imaging mass spectrometry. • computational metabolic and statistical analysis of tissue sections using IMS data from a MALDI-FTICR • immunophenotype-guided annotation of tissue regions • patient stratification using machine learning algorithms • automatic functional peak annotation • data visualization • network & pathway analysis and more.

As part of my doctoral studies, I am involved in the analysis of plant genomes. I computationally annotate and characterize pseudogenes in economically important crops like barley, rye or wheat. Those plants have huge and complex genomes and require much computational power and parallel processing.

http://mips.helmholtz-muenchen.de/plant/index.jsp